A aplicação de vacinas para alergia é chamada de imunoterapia específica. Consiste na introdução de mínimas porções da substância a que a pessoa é alérgica, de modo contínuo, até o organismo não reagir mais de forma anormal àquela substância (antígeno). Pode ser aplicada pelas vias subcutânea (aplicação na clínica) ou sublingual (uso domiciliar). O tratamento com vacinas para alergia é eficaz, diminuindo sintomas e melhorando a qualidade de vida dos pacientes alérgicos. Muitas vezes, a imunoterapia faz com que a pessoa consiga diminuir ou até mesmo não necessitar mais de medicamentos. É o único tratamento capaz de modificar a história natural da doença proporcionando o controle da doença. No caso da rinite, por exemplo, o tratamento é capaz de evitar a evolução para asma.